DNA Methylation Kit

DNA甲基化试剂盒

¥898.00

CW2140M

50 preps

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本试剂盒基本原理为DNA经亚硫酸氢盐处理后,可使未甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变。

本试剂盒采用碱变性的处理方法,能够在温和条件下使DNA双链变性,保证DNA完整性的同时提高转化效率,转化效率可达到99.5%以上。同时通过转化产物与吸附柱结合,从亚硫酸氢盐修饰后的溶液中回收纯化DNA,回收的DNA纯度高,完整性好,可直接用于测序、甲基化PCR检测、芯片分析等下游实验。


高转化效率:未甲基化的胞嘧啶转化效率大于99.5%

高核酸完整性:对核酸的损伤小,有利于下游检测

高回收率:回收率大于80%

高样本兼容性:可兼容投入量范围为100pg-2μg的DNA、cfDNA

保存条件 运输条件
吸附柱DF 2-8℃保存,其余组分室温(15-30℃)保存 常温
Q1: 输入的DNA在转化之前是否应该溶解在 TE、水或其他缓冲液中?
A1:

水、TE 或改良的 TE 缓冲液可用于溶解 DNA,并且不会干扰转化过程。

Q2:甲基化转化时间可以延长吗?
A2:

甲基化转化过程中,转化时间过久会引起甲基化的C部分变成U,导致假阴性,请严格按照操作说明书进行操作。

Q3:亚硫酸氢盐处理的DNA定量需要注意什么?
A3:

对基因组DNA进行亚硫酸氢盐处理后,因为非甲基化的胞嘧啶残基转化为尿嘧啶,所以原始碱基配对不再存在,回收的DNA通常富含AUT,并且在室温下为单链,具有有限的非特异性碱基配对。260 nm处的吸收系数与RNA的吸收系数相似。当纯化后的基因组DNA OD2601时,相当于约40 μg/mL的核酸浓度。

Q4:处理后核酸检测OD值异常是为什么?
A4:

基于处理后核酸状态的特殊性,其OD230会出现异常现象,可能导致OD260/OD230比值不稳定,实验表明这种情况不影响后续的PCR反应。OD260/OD280比值应为1.7-1.9。如果洗脱时不使用洗脱缓冲液,而使用ddH2O,比值会偏低,因为pH值和离子存在会影响光吸收值,但并不表示纯度低。

Q5:后续的PCR扩增条件建议是什么?
A5:

通常,亚硫酸氢盐转化的DNA需要35至40个循环才能成功进行PCR扩增,最佳扩增子大小应在150-300 b p之间,但是通过优化PCR条件可以生成更大的扩增子(高达1 kb),55-60℃之间的退火温度通常效果良好。由于大多数非甲基化胞嘧啶残基会转化为尿嘧啶,因此亚硫酸氢盐处理的DNA通常富含 AT,也正因为这样,非特异性 PCR 扩增也会相对常见,强烈建议使用“热启动”聚合酶进行亚硫酸氢盐处理后DNA 的PCR扩增。

注:康为世纪CW3332FastStar Probe Kit (for bisDNA) 主要应用于以亚硫酸氢盐处理的DNA为模板的探针法荧光定量PCR。其中的SuperFastStar DNA Polymerase是一种经双单克隆抗体修饰的、全新高效热启动酶。

Q6:DNA回收率较低可能的原因和解决方案?
A6:

(1)对转化产物的定量方式选择错误:转化产物以单链形式存在,应使用ssDNA定量方式。

(2)Input DNA有杂质:确保DNA的A260/A280比值在1.8 - 2.0之间;

(3)漂洗缓冲液乙醇含量不足:请加入试剂瓶标签上指定体积的无水乙醇,勿长时间开盖放置; 

4)缓冲液DB中有机溶剂含量不足:请勿长时间开盖放置;

Q7:DNA转化率低可能的原因和解决方案?
A7:

(1)转化液失效:转化液对光敏感,应避光保存,避免暴露在光线下;

(2)反应温度或时间设置错误:请按照说明书正确设置反应温度与时间;

3Input DNA样本GC投入量过高:应根据样本特殊性适当减少投入量。     

Q8:亚硫酸氢盐修饰后的DNA如何储存?
A8:

亚硫酸氢盐修饰后的DNA建议立即检测,否则请于-20℃以下保存,保存时间不超过1个月,长期保存需置于-70℃或以下,并应避免反复冻融。

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