1) 投入量过多或过少。解决办法：RNA浓度低会造成测量的纯度低，可以增加投入量，组织请勿超过20 mg，细胞请勿超过5 × 10⁶个，过量的样本投入量反而会降低得率和纯度。

2) 盐离子残留。解决办法：进行Buffer RW2漂洗两次；加入Buffer RW2时可沿吸附柱管壁四周加入；加入Buffer RW2后，颠倒混匀2 - 3次；加入Buffer RW2后，静置5 min，然后离心。

3) 乙醇残留。解决办法：进行空离2 min，将吸附柱置于室温数分钟以彻底晾干，小心从收集管上取下吸附柱，避免接触乙醇。