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服务介绍
纳米孔测序是一种区别于传统Sanger测序的创新测序技术,能够实现更快、更准、更便捷的测序方法。其工作原理是将DNA的一条链通过纳米级的小孔,根据实时监测并记录核酸链通过纳米孔的电流变化图谱,直接将不同碱基产生的特征性电流信号识别成对应的碱基,以此实现核酸序列的读取。因此无需合成引物和PCR扩增过程即能快速读取出长达上百万个碱基的读长数据,具有超长读长的显著优势。康为世纪通过创新的第四代纳米孔测序进行PCR产物测序服务,1天即可交付测序结果!
高准确度
从第一个碱基到最后一个碱基均准确,一致性序列准确度达到99.99%
极速交付
结果无需拼接,最快12小时内交付测序结果
无需引物
测序无需引物,送样便捷
交付全面
交付全长序列、ab1峰图、变异列表、片段分布图等多种文件类型
服务目录
| 测序项目 | 样本类型 | 片段长度(bp) | 价格(元) | 交付周期(自然日) | 交付内容 |
|---|---|---|---|---|---|
| PCR片段测通/单倍型分析 | PCR已纯化/PCR未纯化/PCR胶块 | ≤1500 | 10 | 1日 | PCR片段序列(.fasta)、色谱图(.ab1)、Bam文件、片段长度分布图等,单倍型分析额外交付两个单倍型序列文件 |
| 1500-3000 | 20 | ||||
| 3000-10000 | 50 | ||||
| 10000-20000 | 70 | ||||
| >20000 | 咨询 |
特色服务:单倍型分析
对于存在二倍体杂合序列的待测区域,一代测序无法确定变异具体位于哪一条单倍型上;而康为纳米孔测序则能够有效解决二倍体样本的单倍型分析问题,在PCR片段测通基础上实现单倍型序列的准确拆分,精准交付两条单倍型的完整序列信息。
送样要求
PCR未纯化样本要求
PCR已纯化样本要求
PCR胶块样本要求
| 片段长度 | 体积要求 | 浓度要求 | 总量要求 | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Qubit检测 | Nanodrop检测 | Qubit检测 | Nanodrop检测 | ||
| ≤ 2 kb | ≥ 20 μL | ≥ 10 ng/μL | ≥ 30 ng/μL | ≥ 200 ng | ≥ 600 ng |
| 2-3 kb | ≥ 20 μL | ≥ 25 ng/μL | ≥ 75 ng/μL | ≥ 500 ng | ≥ 1500 ng |
| > 3 kb | 咨询 | ||||
- a. Qubit浓度测定特异性强,能有效避免其他杂质的干扰;采用Nanodrop测定的数值,建议不低于上述Qubit浓度要求的3倍。
- b. 样品纯度(Nanodrop检测):OD260/280在1.8-2.0,OD260/230在2.0-2.2;溶液中不含去污剂、表面活性剂、变性剂、螯合剂、高浓度的盐和蛋白质。
- c. 样品溶于超纯水中(双蒸水、Milli-Q等),不要使用TE溶解。
- d. 采用琼脂糖凝胶电泳对PCR产物进行检测,存在明亮条带,无明显拖带。非特异性扩增条带较多的,建议送切胶纯化样本。
- e. 送检方式:联系当地取样员取样,或冰袋寄送。
| 片段长度 | 体积要求 | 浓度要求 | 总量要求 | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Qubit检测 | Nanodrop检测 | Qubit检测 | Nanodrop检测 | ||
| ≤ 2 kb | ≥ 15 μL | ≥ 8 ng/μL | ≥ 24 ng/μL | ≥ 120 ng | ≥ 360 ng |
| 2-5 kb | ≥ 15 μL | ≥ 20 ng/μL | ≥ 60 ng/μL | ≥ 300 ng | ≥ 900 ng |
| 5-10 kb | ≥ 15 μL | ≥ 40 ng/μL | ≥ 120 ng/μL | ≥ 600 ng | ≥ 1800 ng |
| > 10 kb | 咨询 | ||||
- a. Qubit浓度测定特异性强,能有效避免其他杂质的干扰;采用Nanodrop测定的数值,建议不低于上述Qubit浓度要求的3倍。
- b. 样品纯度(Nanodrop检测):OD260/280在1.8-2.0,OD260/230在2.0-2.2;溶液中不含去污剂、表面活性剂、变性剂、螯合剂、高浓度的盐和蛋白质。
- c. 样品溶于超纯水中(双蒸水、Milli-Q等),不要使用TE溶解。
- d. 采用琼脂糖凝胶电泳对PCR产物进行检测,存在明亮单一条带,无明显拖带。
- e. 送检方式:联系当地取样员取样,或冰袋寄送。
| 片段长度 | 电泳上样 体积要求 |
浓度要求 | 总量要求 | ||
|---|---|---|---|---|---|
| Qubit检测 | Nanodrop检测 | Qubit检测 | Nanodrop检测 | ||
| ≤ 2 kb | ≥ 20 μL | ≥ 10 ng/μL | ≥ 30 ng/μL | ≥ 200 ng | ≥ 600 ng |
| 2-5 kb | ≥ 20 μL | ≥ 25 ng/μL | ≥ 75 ng/μL | ≥ 500 ng | ≥ 1500 ng |
| 5-10 kb | ≥ 20 μL | ≥ 50 ng/μL | ≥ 150 ng/μL | ≥ 1000 ng | ≥ 3000 ng |
| > 10 kb | 详询 | ||||
- a. 浓度说明:Qubit浓度测定特异性强,能有效避免其他杂质的干扰;采用Nanodrop测定的数值,建议不低于上述Qubit浓度要求的3倍。
- b. 明亮条带:采用琼脂糖凝胶电泳对PCR产物进行检测,存在明亮单一条带。
- c. 胶块大小:实验室不提供切胶服务,所以应在送样前做好胶块的处理。切胶时应尽可能地切除目的条带周围多余的琼脂糖,减少凝胶体积以提高回收效率。
- d. 运输条件:胶块可转入1.5 mL离心管或其他一次性容器中,以便实验人员能取出胶块进行实验。使用封口膜密封管口以防泄漏和污染,联系当地取样员取样,或使用冰袋寄送样本。长途运输不建议送胶块样本,应当送已纯化产物。
场景应用
应用一:模拟ab1文件全新升级,直接可视化关键突变信号,助您快速识别与判断。
应用二:攻克一代测序首端盲区。
应用三:杂合位点更清晰直观。
常见问题
Q1:膜上完全无信号或信号极弱,应如何排查?
Q1:膜上完全无信号或信号极弱,应如何排查?
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