DNA在下游应用中表现不佳通常由以下原因导致：

1. 洗脱液中DNA含量极低。解决办法：请参考前文A2部分的解决方案。

2. 乙醇残留。解决办法：70%乙醇洗涤后，彻底吸弃上清，室温风干 5–10分钟

3. 存在盐离子残留。解决办法：确保异丙醇在室温（15 - 25°C）下沉淀，并用冷的70%乙醇洗涤沉淀两次；可重新沉淀DNA以除去盐。

4. DNA用量过多影响下游实验。解决办法：过量DNA可能抑制酶反应，建议使用分光光度计在260nm处测定DNA浓度，精确控制使用量。