1) 蛋白污染（A260/A280偏低）：裂解不充分或酚类物质残留可能导致蛋白污染。确保组织在液氮中充分研磨，细胞完全分散在Buffer RL中；裂解后充分离心取上清；Buffer RL中务必按1mL加10 μL的比例添加β-巯基乙醇。

2) 有机溶剂或盐残留（A260/A230偏低）：漂洗步骤不彻底或乙醇残留可能导致杂质残留。严格按说明使用Buffer RW2（首次使用前需加入无水乙醇）；最后空离后开盖晾干吸附柱2-3分钟，确保乙醇完全挥发。

3) 样本类型特殊：脂肪组织或脑组织等样本中可能含大量有机物。建议减少起始样本量。

4) 操作或耗材问题：操作中引入污染物。全程使用无RNase枪头、离心管；避免频繁开启试剂瓶。