1) 样本投入量过多。解决办法：减少样本投入量，DNA/RNA含量丰富的特殊样本（肝、脾及肾脏等），请勿超过10 mg，过量的样本投入量反而会降低得率和纯度。

2) 样本研磨或匀浆不充分。解决办法：增加样本研磨或匀浆时间；将裂解样本先12,000 rpm离心5 min，部分样本离心后表面可能有脂质层，转移上清液时请注意。

3) 样本富含肌纤维。解决办法：肌肉、心脏、皮肤和一些低等生物等富含肌纤维的样本，应采用液氮研磨方式，加大研磨程度。

4) 裂解液粘稠。解决办法：增大裂解液体积。

5) 样本复杂。解决办法：高脂肪、高纤维、高蛋白、多糖类、多杂质等复杂样本使用操作步骤（常规），并减少投入量。